注冊會計(jì)師的查賬對象是會計(jì)的賬冊憑證。在經(jīng)濟(jì)業(yè)務(wù)相對簡單且反映的業(yè)務(wù)內(nèi)容不甚較多的情況下，注冊會計(jì)師可以通過翻閱賬本作出較有把握的結(jié)論。然而，到了二十世紀(jì)之后，隨著公司規(guī)模的擴(kuò)大以及業(yè)務(wù)內(nèi)容的創(chuàng)新，特別是股份制企業(yè)在地域上或業(yè)務(wù)量上的無限擴(kuò)張，使得注冊會計(jì)師所需審核的會計(jì)信息越來越寬泛。過去那種依靠傳統(tǒng)的逐頁核對、逐筆檢查的手工方法，既曠日費(fèi)時(shí)，也無法作出質(zhì)量保證。于是，一些聰明的注冊會計(jì)師開始將眼光轉(zhuǎn)向了產(chǎn)生這些會計(jì)信息的過程。如果在收集、整理、匯總以及核算會計(jì)報(bào)表過程中，有很好的控制保護(hù)措施，那么會計(jì)報(bào)告的質(zhì)量也應(yīng)該是可靠的。而觀察會計(jì)報(bào)告的產(chǎn)生過程，比盲目地逐筆核對，要省時(shí)省力得多，也科學(xué)得多。于是，注冊會計(jì)師開始走出舍本求木的誤區(qū)，關(guān)注起與報(bào)表信息產(chǎn)生過程有關(guān)的內(nèi)部控制。
    所謂的企業(yè)內(nèi)部控制，實(shí)質(zhì)上是為了保證業(yè)務(wù)活動(dòng)的有效運(yùn)行，保護(hù)資產(chǎn)的安全和完整，防止、發(fā)現(xiàn)、糾正錯(cuò)誤和舞弊，保證會計(jì)資料的真實(shí)、合法、完整而制定和實(shí)施的政策與程序。而作為注冊會計(jì)師，在審計(jì)客戶之前，對其內(nèi)部控制主要關(guān)注如下兩點(diǎn)：
    1. 財(cái)務(wù)報(bào)告的可靠性。確保財(cái)務(wù)報(bào)告可靠性的內(nèi)部控制，直接影響到財(cái)務(wù)報(bào)表和相關(guān)的各種認(rèn)定，從而影響審計(jì)目標(biāo)的實(shí)現(xiàn)。如果影響財(cái)務(wù)報(bào)告可靠性的內(nèi)部控制不健全，財(cái)務(wù)報(bào)表就不太可能符合企業(yè)會計(jì)準(zhǔn)則和有關(guān)財(cái)務(wù)會計(jì)法規(guī)的要求。因此，注冊會計(jì)師應(yīng)關(guān)注被審計(jì)單位保護(hù)資產(chǎn)和記錄安全完整的內(nèi)部控制，關(guān)注保證經(jīng)濟(jì)業(yè)務(wù)經(jīng)過授權(quán)、符合既定方針政策和國家法律法規(guī)的內(nèi)部控制。
    2. 對各類經(jīng)濟(jì)交易的控制。注冊會計(jì)師特別關(guān)心的是對各類經(jīng)濟(jì)交易的控制，而不是對會計(jì)賬戶余額的控制。原因在于，會計(jì)信息系統(tǒng)的輸出結(jié)果（會計(jì)賬戶余額）的準(zhǔn)確性主要依賴于數(shù)據(jù)輸入和數(shù)據(jù)處理（經(jīng)濟(jì)交易）的準(zhǔn)確性。
    通過對企業(yè)內(nèi)部控制的調(diào)整，注冊會計(jì)師不僅可以減少盲目的賬表核對或函證盤點(diǎn)，而且還可以使審計(jì)報(bào)告的結(jié)論更具準(zhǔn)確性。因此，通過評價(jià)企業(yè)內(nèi)部控制，找出企業(yè)在編制財(cái)務(wù)報(bào)表過程中的薄弱環(huán)節(jié)，并對之重點(diǎn)審核，已成為注冊會計(jì)師的第三大技術(shù)。

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